正論：
一、建立具需要之本體
二、決定所分十一品
第一品 總示因緣
一、身法及不清凈之體
（一）體：
（二）相：
二、如何錯亂之理
三、分別因緣
（一）析因——六因：
（二）析緣——四緣：
四、分別三時住
（一）不凈：
（二）雜染：
（三）清凈：
第二品 身之成立
一、略述：
二、廣述：
（一）總析三界之理
1、初、無色界：
2、次、色界：
3、後、欲界：
（二）別析受身之理
1、析化生
2、析胎生
（1）初、依六界因緣生之次第
（2）中、入胎
（3）後、生身次第
①析大命氣命如何出生：
②析十月增長次第：
③析氣脈明點圓滿及其出生時理：
三、結論：
第三品 釋脈
一、略述
二、廣述
（一）中左右脈
1、述體：
2、左右脈與教相合：
（二）主母脈二十四及三十七之決定
1、總析
2、認識二十四脈
3、析隱藏五脈
（三）廣說輪脈
1、略析
2、臍輪
3、心輪
4、喉輪
5、頂輪
6、六輪
（1）《金剛蔓經》所述
（2）余經所述
7、十二支輪
（四）生病脈
（五）廣述七萬二千脈
（六）微細脈與界相合情形
三、結論
第四品 釋氣
一、略說
二、廣述
（一）能生所生之本體
（二）住與作用
（三）內外氣行動與作用
1、內行法
2、外行法
（1）總說
（2）廣析時集合
（3）析中脈氣
3、行次第、顏色、力量、功德
4、各密經引證
（四）氣趨入之門、持氣之法與其利益
（五）一切世、出世氣之自性
三、結論
第五品 釋明點
一、略說
二、廣述
（一）離戲明點
（二）錯亂明點
（三）物明點
1、中有緣受生（前已詳）
2、凈分
3、濁分
4、三十六界（十二凈分與二十四濁分）
5、白分遷移次第
（四）能對治之智慧明點修法
（五）兼言除明點之過患
三、結論
第六品 釋四住時識智相合
一、略說
二、廣述
（一）總析
（二）析厚睡時
（三）夢時
1、凈不凈本體
2、廣析夢境
3、修夢法及其果
（四）貪時
1、凈、不凈本體
2、生死流轉
3、涅盤次第
4、修法及其本體
（五）平時
1、體
2、清凈
3、舍離之果
第七品 內身與器世間相配
一、略說
二、廣述
（一）析除處
（二）大種次第安立
（三）諸山
（四）諸洲
（五）內大種、（六）諸海
（七）諸星曜
（八）火
（九）四生處
（十）與時相配
三、結論
第八品 分別本尊壇城出生之理
一、略說
二、廣述
（一）本尊數決定
（二）壇城決定
（三）福慧相配
（四）析起正決定
三、結論
第九品 能凈所凈一切法根本
一、略說
二、廣述
（一）析真假二諦
（二）斷邪分別
1、外道
2、小乘
（三）斷及對治根本
（四）別說密部對治之決定
（五）廣說
（六）本尊與氣三脈配合
1、本尊與智慧氣相配合
（1）時輪
（2）大小勝樂輪
（3）大幻化網
（4）密集諸本尊
（5）余續諸尊
2、脈與本尊相配
（1）時輪
（2）吉羊勝樂輪
（3）大幻化網、（4）密集金剛
（5）本尊與余經論相配
三、結論
第十品 正析道次第
一、略說
二、廣述
（一）共道（1、聲聞；2、辟支佛；3、般若乘）
（二）不共道
1、四部密宗時量差別
2、析道
（1）資糧道
（2）加行道
（3）見道
（4）修道
①體
②滅除見修習氣
（5）究竟道
三、結論
第十一品 收攝氣脈明點
一、略說
二、廣述
（一）脈收攝
1、收攝普通脈次第
2、收攝十八輪脈次第
3、收攝二十四脈
（二）氣死相（氣收攝）
1、十氣之收攝
2、中脈死與非時死
（1）增長次第（外出氣數）
（2）中脈真實死相
3、右太陽氣非時死相
4、左月亮氣死相
5、彼等之決定
（三）明點死相（明點收攝）
1、由九十七年計算
2、由三年三方計算
（四）兼析遷移之還滅（識往生）
三、結論
結論 攝一切義者，令通達明藏並回向發願
一、析總義
二、三藏義
（一）對法
1、外對法
2、內對法
（二）經藏之理
（三）律藏之理
三、密乘之別要
四、總析自性果
五、本論根據
六、於薄伽梵事業恭敬贊嘆並回向忍敕
（一）贊嘆
（二）回向
（三）請忍敕
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